El Centro I-Mar de la Universidad de los Lagos, está desarrollando importantes estudios relacionados a la obtención de nuevos compuestos antimicrobianos que puedan ser usados como alternativas para el tratamiento de enfermedades en la acuicultura a partir de genomas bacterianos asociados a esponjas marinas en el mar austral de Chile.

La aplicación de estos compuestos antimicrobianos, junto con las vacunas, no siempre ha sido efectiva y exitosa en la acuicultura, ya que la eficacia se ha visto limitada por la aparición de cepas resistentes o nuevas cepas patógenas, como también por las restricciones ambientales al uso de antibióticos utilizados también para salud humana.

Por ello, se hace necesaria la búsqueda de nuevas alternativas para el tratamiento de enfermedades. Estas alternativas deben cumplir con la condición de ser eficaces y específicas para los patógenos a fin de disminuir los riesgos de generación de resistencia, y en segundo lugar que no presenten relación con el uso de antimicrobianos usado en la medicina humana.

Esta línea de investigación, comenzada con la llegada del Dr. Félix Godoy al Centro I-Mar, se ha visto fortalecida por la reciente adjudicación del proyecto “Obtención de nuevas alternativas antimicrobianas para el tratamiento de patógenos de salmones, mediante prospección metagenómica en bacterias asociadas a esponjas marinas” (código 11IDL2-10475), que junto con la empresa SurBioTec S.A. fue postulado al Concurso de Innova CORFO de I+D aplicada.

Según explica el Director del proyecto, Dr. Godoy, el descubrimiento de nuevas estructuras de compuestos bioactivos

a partir de ambientes marinos ha indicado que este ambiente constituye una fuente rica de compuestos antimicrobianos, dando lugar a que en las últimas dos décadas una gran proporción de estos compuestos hayan sido aislados desde organismos marinos.

Especial interés representan los microorganismos debido a sus mayores facilidades para la producción industrial de compuestos con potencial biotecnológico y por la gran diversidad genética que poseen. Por otra parte, debido al creciente desarrollo de nuevas técnicas moleculares y nuevas tecnologías de secuenciación de ADN, hoy en día es posible acceder al amplio reservorio genético que se encuentra en las comunidades bacterianas ambientales y que aún se mantiene inexplorado.

Estas herramientas genómicas han probado ser una poderosa herramienta para la exploración y obtención de nuevos compuestos bioactivos de importancia industrial. Gran parte de esta búsqueda se ha orientado a aquellos microorganismos asociados a tejidos de invertebrados (ej. esponjas marinas) los cuales forman parte de nichos únicos de alta densidad numérica y que por sus relaciones simbióticas suelen ser capaces de producir una variedad importantes de compuestos bioactivos. Este proyecto, tiene como objetivo la obtención de nuevos compuestos antimicrobianos desde ambientes marinos mediante el desarrollo de herramientas genómicas de última generación.

En definitiva, con el desarrollo del proyecto se espera proveer a la industria acuícola de nuevas alternativas antimicrobianas naturales que permitan disminuir las pérdidas económicas causada por las infecciones microbianas y aminorar el impacto causado por los antibióticos usados en medicina humana.